数据驱动的基因调控网络建模
王勇
(中国科学院数学与系统科学研究院)
报告时间:15:00-16:30,2021-10-20(星期三)
报告地点: E-404
内容简介:人类基因组是一本生命之书。2021年,距离人类基因组工作草图发表已过去20年,然而这本书还没有被完全读懂。主要的难点在于和复杂性状和疾病关联的遗传变异落在98%的非编码区域,这些非编码区域对于基因的调控是非线性、组织、条件特异的。即在特定的条件下,特定基因表达的启动或停止,增强或抑制,由基因组中的调控元件及其相互作用完成,这一过程是细胞对外界刺激作出应答的分子基础,是健康和疾病研究的基石。我们将报告从多组学测序数据推断组织特异基因调控网络方面的研究进展,探讨用数学模型来从数据中定量描述转录因子与增强子在特定的细胞环境下的合作,控制基因的时空特异表达。进一步阐述如何利用该调控结构解析遗传变异等挑战性问题。
报告人简介:王勇,中国科学院数学与系统科学研究院应用数学研究所研究员,国家杰出青年基金获得者。1999 年从内蒙古大学数学系的数学物理专业本科学位,2002 年从大连理工大学应用数学系获得运筹学与控制论硕士学位,2005年从中国科学院数学与系统科学研究院获得运筹学与控制论专业的理学博士学位。主要从事运筹学与生物信息学、系统生物学的交叉研究。采用融合最优化、统计和动力系统的数学建模,(1)重点研究生物分子网络,在数学上找出产生多组学数据的调控网络,揭示因果关系。(2) 重点研究生物医学数据分析集成,研究数据的基本数学结构,通过建模分离信号与噪声。
邀请人:韩德仁